تمر عملية التخليص الجمركي بعدة مراحل أساسية، من أبرزها:
- تقديم البيان الجمركي متضمناً تفاصيل الشحنة.
- إرفاق المستندات المطلوبة مثل الفاتورة التجارية، بوليصة الشحن، شهادة المنشأ.
- فحص البضائع (مستنديًا أو ميدانيًا عند الحاجة).
- تحديد الرسوم الجمركية المستحقة وفقًا لنوع البضاعة وقيمتها.
- سداد الرسوم والحصول على إذن الإفراج عن الشحنة.